校正染料(ROX)的使用显著降低样品添加误差或孔间误差,为实验提供稳定的基线,这在定量分析中极大地提升了准确性,并增强了重复测定之间的数据重现性。需要注意的是,不同设备对ROX的需求可能有所不同。
在基线PCR的初始循环阶段,荧光信号几乎没有变化,这为阈值设定提供了可靠的参考。CT值与阈值交点的横坐标可以用来评估结果的有效性。有效性评估的关键要素包括以下几个方面:
1. **融解曲线单峰(染料法)**:确保扩增曲线在指数增长区域内呈现明显的单峰特征。
2. **重复孔间CT值标准差(STD)小于0.2**:这表明数据的一致性良好。
3. **合理的阈值设置**:阈值应位于指数增长期内,虽然仪器会自动计算阈值,但并非所有情况下计算结果均合理,必要时应进行手动调整。
4. **NTC确认无气溶胶污染**:NTC(No Template Control)使用水替代模板;若ΔCT=NTC(CT值) - 目的基因(CT值)≥3或≥5,可认为实验中未受到气溶胶污染的影响,结果可靠。
5. **NRT确认无基因组残留**:NRT(No RT Control)是在逆转录反应中,除了逆转录酶,其他组分正常添加;若ΔCT=NRT(CT值) - 目的基因(CT值)≥3或≥5,说明基因组残留不会影响结果的准确性。
6. **扩增效率检测**:待测CT值应处在线性范围内,PCR扩增效率(e)应在90%-120%之间。
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